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Zur langfristigen Bewahrung der biologischen Vielfalt in Thüringen engagiert sich die Landesregierung aktiv in den folgenden Bereichen:
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Nur was wir kennen, können wir schützen! Unsere gemeinsame landesweite Datengrundlage sind die in den 1990er Jahren begonnenen Artenerfassungen und Biotopkartierungen. So stehen z.B. über die Verbreitung von Farn- und Blütenpflanzen in Thüringen flächendeckend Daten zur Verfügung. Der Gefährdungszustand von Arten und Lebensräumen wird alle zehn Jahre in den Roten Listen Thüringens veröffentlicht. Aktuell gilt die 3. Fassung aus dem Jahr 2011.
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So vielfältig wie die natürliche Ausstattung Thüringens ist, so vielfältig müssen auch die Aktivitäten zu ihrem Schutz sein! Derzeit schützt die Landesregierung Artenvorkommen, Lebensräume und Landschaften in Thüringen vor allem durch folgende Instrumente:
• die Beteiligung am europäischen Schutzgebietsnetz 
Natura 2000,
• spezielle Artenhilfsmaßnahmen, z.B. für Fledermäuse oder für Pflanzenarten wie den Frauenschuh,
• Ausweisung und Pflege von Schutzgebieten,
• Durchführung von EU LIFE+ Projekten und Naturschutzgroßprojekten (siehe Marginalspalte) sowie
• durch Unterstützung von Landwirten, Verbänden, Vereinen und Kommunen mithilfe von Vertragsnaturschutzprogrammen (z.B. KULAP) und mithilfe des Programms „Entwicklung von Natur und Landschaft“ (ENL).
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Der Begriff 
Biotopverbund beschreibt die (Wieder-)Vernetzung von Lebensräumen – regional, auf Bundesebene, aber auch in Europa.
Warum ist das notwendig? Der zunehmende Nutzungsdruck auf die Landschaft lässt naturnahe Lebensräume immer mehr zu Inseln für Tiere und Pflanzen werden. Im Jahr 2009 etwa wurden in Thüringen täglich 2,7 Hektar neue Siedlungs- und Verkehrsflächen erschlossen. Wo Tiere und Pflanzen nicht mehr wandern können, ist ihr dauerhaftes Überleben in Gefahr. Thüringen beteiligt sich deshalb am bundesweiten Biotopverbundsystem und entwickelt ein Konzept zur Umsetzung. Thüringen hat einen 763 Kilometer langen Anteil (ca. 6400 Hektar Fläche) am Grünen Band. Entlang der ehemaligen innerdeutschen Grenze existiert ein einzigartiges System von Lebensräumen. Es soll als zusammenhängender Korridor für die Ausbreitung wildlebender Tiere und Pflanzen erhalten bleiben.
Rote Listen 2011